Goedaardig gepigmenteerde afwijkingen van de huid zijn er in vele vormen. Sproeten, bij sommige mensen in overvloed aanwezig, behoren ook daartoe. Moedervlekken, zijn vaak al vanaf de geboorte aanwezig of ontstaan op latere leeftijd, evenals de ouderdomsvlekken. Na sommige huidziekten kunnen bruine verkleuringen ontstaan. Dankzij het feit dat de IPL-apparatuur in staat is lichtpulsen in een veelheid van verschillende golflengten (kleuren) te produceren is het mogelijk gekleurde huidveranderingen makkelijker te verwijderen.

Het licht wordt geabsorbeerd door het pigment in de huid, waardoor de vlek afgebroken wordt. Het omringende weefsel en de erboven liggende huid blijft hierbij intact omdat deze niet gevoelig is voor de gekozen golflengte van de lichtbundel. Na de behandeling verdwijnt de vlek langzaam, doordat de restanten ervan door het lichaam op natuurlijke wijze worden afgevoerd.